MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 16797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018664	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018664	TAT	2	6	32	37	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018664	AT	3	6	1475	1480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018664	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018664	TA	4	8	1535	1542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018664	T	6	6	1561	1566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018664	TAC	3	9	1612	1620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018664	TAC	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018664	TAT	3	9	1641	1649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018664	AGG	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018664	TAT	2	6	2835	2840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018664	AGG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018664	T	9	9	3082	3090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018664	ATA	2	6	3096	3101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018664	AAGA	2	8	3128	3135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018664	A	6	6	3137	3142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018664	GGA	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018664	GAG	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018664	T	6	6	9040	9045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018664	GT	3	6	9066	9071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018664	ATA	2	6	9098	9103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018664	TA	3	6	9105	9110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018664	T	6	6	9114	9119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018664	GAG	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018664	T	8	8	10730	10737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018664	AT	3	6	10771	10776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018664	A	7	7	10850	10856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018664	A	6	6	10862	10867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018664	AAAGAA	2	12	10876	10887	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018664	AGT	2	6	10897	10902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018664	CGC	2	6	10909	10914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018664	AAG	2	6	10936	10941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018664	A	6	6	10946	10951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018664	A	6	6	10956	10961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018664	CTT	2	6	10962	10967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018664	TAA	2	6	11055	11060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018664	CAG	2	6	11091	11096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018664	GGC	2	6	11154	11159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018664	GCG	2	6	11228	11233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018664	CCTT	2	8	11258	11265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018664	CAC	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018664	GGT	2	6	11346	11351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018664	CGA	2	6	11406	11411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018664	GCA	2	6	11480	11485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018664	CGC	2	6	11527	11532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018664	GTGA	2	8	11533	11540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018664	AGG	2	6	11596	11601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018664	CAG	2	6	11623	11628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018664	ATT	2	6	11664	11669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018664	GGC	2	6	11688	11693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018664	AGG	2	6	11812	11817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018664	AGC	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018664	GAA	2	6	12073	12078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018664	GGT	2	6	12147	12152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018664	GTC	2	6	12161	12166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018664	TCGTG	2	10	12170	12179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018664	CAT	2	6	12229	12234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018664	GAT	2	6	12262	12267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018664	GGA	2	6	12273	12278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018664	ATC	2	6	12297	12302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018664	AC	3	6	12324	12329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018664	AC	3	6	12493	12498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018664	CAC	2	6	12508	12513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018664	AGG	2	6	12552	12557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018664	GAT	2	6	12578	12583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018664	CCT	2	6	12634	12639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018664	GA	3	6	12674	12679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018664	AT	3	6	12824	12829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018664	AT	3	6	12832	12837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018664	AAT	2	6	12856	12861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018664	AGT	2	6	12868	12873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018664	GAA	2	6	12956	12961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018664	AGAA	2	8	13129	13136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018664	GCG	2	6	13155	13160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018664	ACATA	2	10	13213	13222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018664	AG	3	6	13245	13250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018664	CCA	2	6	13261	13266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018664	G	6	6	13355	13360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018664	ACC	2	6	13361	13366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018664	C	6	6	13365	13370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_018664	TAC	2	6	13380	13385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018664	GGGAG	2	10	13437	13446	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018664	GCA	2	6	13544	13549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018664	GTT	2	6	13557	13562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018664	AAGTG	2	10	13797	13806	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018664	TG	3	6	13900	13905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018664	ATC	2	6	13939	13944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018664	AGC	2	6	14019	14024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018664	CATT	2	8	14025	14032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018664	GTG	2	6	14172	14177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018664	AG	3	6	14189	14194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018664	GGTG	2	8	14217	14224	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018664	ACA	2	6	14323	14328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018664	TAC	2	6	14343	14348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018664	AGG	2	6	14378	14383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018664	GAG	2	6	14572	14577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018664	GAA	2	6	14596	14601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018664	AGC	2	6	14682	14687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018664	CGG	2	6	14845	14850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018664	CAA	2	6	14939	14944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018664	GTA	2	6	14961	14966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018664	TGG	2	6	15095	15100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018664	ACC	2	6	15116	15121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018664	ATG	2	6	15125	15130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018664	CCT	2	6	15204	15209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018664	CGT	2	6	15535	15540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018664	CGT	2	6	15561	15566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018664	GAG	2	6	15584	15589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018664	AAGAT	2	10	15719	15728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018664	GCA	2	6	15795	15800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018664	AT	3	6	15844	15849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018664	AAT	2	6	15855	15860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018664	A	6	6	15899	15904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018664	T	7	7	16029	16035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018664	T	7	7	16037	16043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018664	AAT	2	6	16045	16050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018664	ATTAA	2	10	16051	16060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018664	T	6	6	16082	16087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018664	ATA	2	6	16135	16140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018664	AT	4	8	16161	16168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018664	ATA	2	6	16230	16235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018664	A	8	8	17979	17986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018664	TA	3	6	19585	19590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018664	TCT	3	9	20302	20310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018664	TAAAA	2	10	20321	20330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018664	TTTTA	2	10	20346	20355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018664	ATTA	2	8	20368	20375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018664	A	7	7	20375	20381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018664	TAATG	2	10	20401	20410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018664	AGA	2	6	20411	20416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018664	ATT	2	6	20425	20430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018664	TTAAT	2	10	20435	20444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018664	AT	4	8	20443	20450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018664	TA	3	6	20451	20456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018664	ATT	2	6	20481	20486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018664	AATA	2	8	20572	20579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018664	ATA	2	6	20591	20596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018664	TAC	2	6	20609	20614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018664	ATA	2	6	20635	20640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018664	TTG	2	6	20645	20650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018664	GGT	2	6	20654	20659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018664	ATAA	2	8	21317	21324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018664	ATT	2	6	21357	21362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018664	T	6	6	21434	21439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018664	TTA	2	6	21489	21494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018664	ATA	2	6	21532	21537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018664	AAAT	2	8	21560	21567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018664	AAGG	2	8	21571	21578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018664	AT	3	6	24081	24086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018664	TAA	2	6	24927	24932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018664	TAG	2	6	25450	25455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018664	TAG	2	6	25464	25469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018664	ACT	2	6	25483	25488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018664	GATT	2	8	25520	25527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018664	TTA	2	6	27499	27504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018664	TATAA	2	10	27596	27605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018664	ATG	2	6	27630	27635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018664	AT	3	6	27653	27658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018664	TA	5	10	27667	27676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018664	TAA	2	6	27679	27684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018664	GTAAA	2	10	27700	27709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018664	TAT	2	6	27717	27722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_018664	TTAA	2	8	27771	27778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018664	AATT	2	8	28078	28085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018664	AAAC	2	8	28092	28099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_018664	TA	3	6	28107	28112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018664	TAA	2	6	28504	28509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018664	TAA	2	6	28518	28523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018664	TAT	2	6	28537	28542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_018664	TTATA	2	10	29882	29891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018664	CCT	2	6	31231	31236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_018664	ATG	2	6	31242	31247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018664	T	6	6	31263	31268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018664	ATA	2	6	31277	31282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018664	CATA	2	8	31355	31362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_018664	TAGA	2	8	31404	31411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018664	GCTT	2	8	31428	31435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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188	NC_018664	TGG	2	6	31552	31557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_018664	ATT	2	6	31734	31739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_018664	TAAA	2	8	31952	31959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_018664	ATA	2	6	38951	38956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_018664	AAT	2	6	41149	41154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_018664	ATTA	2	8	41345	41352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018664	GAA	2	6	41371	41376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_018664	TAAC	2	8	41378	41385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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442	NC_018664	TAT	2	6	66436	66441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_018664	TTA	2	6	66511	66516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_018664	A	6	6	66709	66714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_018664	AT	3	6	66783	66788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_018664	TACT	2	8	67026	67033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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469	NC_018664	GAA	2	6	69304	69309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
470	NC_018664	TA	4	8	70073	70080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_018664	CT	3	6	70121	70126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
473	NC_018664	AT	3	6	70193	70198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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